Αποτελεί σχετικά συχνό πρόβλημα αφού έχει βρεθεί ότι το 4-10% των παιδιών θα εμφανίσει κάποια στιγμή ουρολοίμωξη ως την έναρξη της εφηβείας. Είναι συχνότερη στα κορίτσια με εξαίρεση τα μικρότερα των 4 μηνών βρέφη όπου εμφανίζεται πιο συχνά στα αγόρια. Η ουρολοίμωξη συχνά συνυπάρχει με ανωμαλίες του ουροποιητικού και ιδιαίτερα με κυστεοουρητηρική παλινδρόμηση σε ποσοστό 30-40%. Υπάρχει όμως και κυστεοουρητηρική παλινδρόμηση σε παιδιά που δεν εμφάνισαν ποτέ ουρολοίμωξη. Είναι κοινή παραδοχή πως πρέπει να γίνεται απεικονιστικός έλεγχος στα παιδιά μετά το πρώτο επεισόδιο ουρολοίμωξης με σκοπό την έγκαιρη ανίχνευση παιδιών που έχουν αυξημένο κίνδυνο να εμφανίσουν μόνιμη νεφρική βλάβη ή απώτερες επιπλοκές, όπως υπέρταση ή χρόνια νεφρική ανεπάρκεια. Εδώ έχει μεγάλη σημασία η πρόληψη της οξείας πυελονεφρίτιδας, ώστε να μην επιδεινωθεί η νεφρική λειτουργία.